====== Sequenzanalyse - ======


====== Meilensteine und aktuelle Themeninhalte, Wintersemester 2013/14 ======
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| **Seminar:** | 392212 | Mi, 14 - 16 Uhr in T2-208 | Linda Sundermann | [[http://ekvv.uni-bielefeld.de/kvv_publ/publ/vd?id=37775003|ekvv]] |

==== Inhalt ====
Dieses Seminar richtet sich an Bachelorstudenten, vor allem an Fünftsemester, die bisher nicht viele Vorträge gehalten und Ausarbeitungen geschrieben haben. Aber auch Bachelorstudenten aus höheren Semestern, die gerne das Schreiben von wissenschaftlichen Texten und das Halten von Vorträgen üben wollen, sind herzlich willkommen.  

Das Seminar gliedert sich in verschiedene Aufgabenbereiche: Am Anfang werden wir über den Aufbau wissenschaftlicher Paper sprechen und uns verschiedene Artikel ansehen.\\ Anschließend wählt jeder Teilnehmer ein Paper aus, zu dem er eine sieben bis zehn Seiten lange Ausarbeitung schreiben soll. Das Schreiben findet teilweise im Seminar statt und wird durch Anleitungen und Beispiele unterstützt. Hier beschäftigen wir uns zum Beispiel mit folgenden Fragen: Wie soll die Arbeit aufgebaut werden? Was gehört in die Einleitung? Wie formuliert man komplexe Zusammenhänge verständig? Wie zitiert man richtig? ...\\ Anschließend findet eine Vorbereitung auf die Seminarvorträge statt. Diese werden am Ende des Semesters gehalten und sollen ca. 20 Minuten lang sein. 

Das Schreiben der Ausarbeitung und die Gestaltung der Vortragsfolien werden mit LATEX durchgeführt. Hierzu werden wir im Seminar Vorlagen erarbeiten. 



==== Anforderungen ====

  * Beteiligung an Besprechungen, Diskussionen und praktische Umsetzung 
  * Vortrag (etwa 20 Minuten) 
  * schriftliche Ausarbeitung (etwa 10 Seiten) 


==== Abgabetermine ====

| **Datum** | **Abgabe**|
| 10.02. | Erste Version der Ausarbeitung an Reviewer |
| 17.02. | Abgabe des Reviews an Verfasser |
| 03.03. | Finale Abgabe der Ausarbeitung an Veranstalter |

==== Termine ====

| **Datum** | **Thema** |
| 16.10.13 | Wie ist ein Paper aufgebaut? |
| 23.10.13 | Paper aussuchen |
| 30.10.13 | {{ 368Schreiben1.pdf | Wie schreibe ich? Richtiges Zitieren. }}  |
| 06.11.13 | {{ 368Schreiben2.pdf | Wie schreibe ich eine Einleitung? Wie beende ich meine Arbeit? }}  |
| 13.11.13 | {{ 368Schreiben3.pdf | Wie benutze ich Tabellen und Abbildungen? }}  |
| 21.11.13 | {{ 368Schreiben4.pdf | Wie gehe ich mit mathematischen und formalen Ausdrücken um? }}  |
| 28.11.13 | {{ 368Schreiben5.pdf | Wie kontrolliere ich meine und die Arbeit von anderen? }}  |
| 04.12.13 | Freiarbeit  |
| 11.12.13 | {{ 368Schreiben6.pdf | Wie halte ich einen guten Vortrag? }}  |
| 18.12.13 | Freiarbeit |
| 08.01.14 | Vortrag Lukas, Martina, Swen|
| 15.01.14 | Vortrag Alex, Kevin, Nicole |
| 22.01.14 | Vortrag Marco, Dominik, Karsten |
| 29.01.14 | Vortrag Jan, Anatoli|
| 05.02.14 | Vortrag Marten, Jens|

==== Themen und Reviews ====

| **Thema** | **Student** | **Reviewer** |
| Nussinov | Alex | Anatoli |
| Boyer-Moore | Marten | Karsten |
| Manber-Myers | Jan | Jens |
| Glimmer | Swen | Jan |
| Needleman-Wunsch | Anatoli | Alex |
| De Bruijn Graphs | Marco | Dominik |
| UCHIME | Martina | Nicole |
| Saruman | Lukas | Kevin |
| MISHIMA | Dominik | Marco |
| Genome compression | Kevin | Lukas |
| CARMA 3 | Karsten | Marten |
| Gene family assignment-free | Jens | Swen |
| AggloDel | Nicole | Martina |\\ 

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