Meetings

1. Nix im Verhaeltnis
2. Baum (non)ultrametric
3. discrete vs. continuous x in [0,1)
4. Keine unsichtbaren Knoten
5. “ Rotes Modell ” vor Schleife die Laenge festlegen
6. Kanten/Knotenebenenweise
7. internal node sequences ausgeben
   • + Liste der Operationen

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• Controller erstellen √
• Controller ruft Mutatoren auf X
• Evoperations aufrufen (Controller) X
• Rearrangements auswählen (Inversionsmethode) X
• Interface für Rearrangement Mutatoren √
• Rearrangement Mutator für Deletion ?
• Rearrangement Mutator für Transposons X
• Rearrangement Mutator für Duplikation X
• Rearrangement Mutator für Translokation X
• Rearrangement Mutator für Inversion X
• Rearrangement Mutator für k-cut&join X
• Wahrscheinlichkeiten für Mutatoren ins RoseData Interface schreiben (setter) X
• Rearrangements loggen X
• Organismen, Sequenzen und Buchstaben tiefenkopierbar √
• Controller durchläuft Baum √
• cut- und join- Operationen √
• Rearrangements abhängig von Annotationen X

knapp 30% √