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        <title>AGGI DokuWiki teaching:2009winter</title>
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        <title>AGGI DokuWiki</title>
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        <description>Arbeitsgruppenseminar Genominformatik



392188 Stoye, Braga Winter 2009/2010 Thursday 16-18 in U10-146 ekvv 
Kurzbeschreibung

In dieser Veranstaltung werden Vorträge über aktuelle Themen aus der Forschung der Arbeitsgruppe Genominformatik gehalten.</description>
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        <description>Algorithmische Implementierung (Übung im WS 2009/2010)



392025 Jens Stoye Winter 2009 Termine: siehe unten ekvv 
Vorgehen:

Bei der Vorbesprechung (oder kurz danach) werden Themen verteilt, zu denen selbstständig in einer Programmiersprache der eigenen Wahl eine Implementierung angefertigt werden soll. Eine Woche vor der Abschlussbesprechung muss der Source-Code an den Betreuer geschickt werden. Zur Abschlussbesprechung präsentiert jeder Teilnehmer seine Software vor allen Teilnehmern. Bei Nic…</description>
    </item>
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        <description>Algorithmen in der Genomforschung



392109/392110 Marília Braga, Jens Stoye Winter 2009/2010 Fr 10:15-11:45/Fr 8:45-10:15 ekvv/ekvv 
Contents:

Die funktionelle Analyse molekularer Genomdaten ist eine der großen Herausforderungen an die Bioinformatik. In dieser Veranstaltung werden die Grundlagen für bioinformatische Techniken in der Genomforschung behandelt. Hierunter fallen Algorithmen zur Genomkartierung und -assemblierung, Methoden zur funktionellen Genomannotation, insbesondere Genvorhersa…</description>
    </item>
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        <description>Automaten und Grammatiken (Seminar im WS 2009/10)



 392020  Jens Stoye  Di 10-12  U10-146  ekvv 
Zeitplan:
13.10.2009  Vorbesprechung  20.10.2009  Beratung  27.10.2009  (entfällt)  03.11.2009  Beratung  10.11.2009  Minimierung von Automaten, Normalformen, Nichtdeterministische Automaten</description>
    </item>
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        <description>Bioinformatics Journal Club



392169 Marília Braga Winter 2009/10 Mo 16-18 in U10-146 ekvv 
Time table:
02/11  ABACAS: algorithm-based automatic contiguation of assembled sequences  Peter Husemann 09/11  :!: CeBiTec Colloquium at 5pm: Profiling Microbial Communities Using Next Generation Sequencing of 16S Ribosomal Genes  Lutz Krause 16/11  Increasing the coverage of a metapopulation consensus genome by iterative read mapping and assembly  Wolfgang Gerlach 23/11  SOrt-ITEMS: Sequence orthology …</description>
    </item>
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        <description>Phylogenetik

Dipl.-Inform. Roland Wittler
Dipl.-Inform. Peter Husemann
Prof. Dr. Jens Stoye


Inhalt, Kommentar

Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein:</description>
    </item>
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        <description>[ Blatt7Aufg3.nex ]
[ Blatt8Aufg1.nex ]
[ surprise.nex ]</description>
    </item>
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        <description>Grundlagen der Sequenzanalyse Wintersemester 2009/2010

Kurzbeschreibung

Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.</description>
    </item>
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        <title>teaching:2009winter:tutorenschulung</title>
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        <description>Tutorenschulung

Was wird eigentlich von mir als Tutor erwartet? Wie kann ich die Studenten in meinem Tutorium motivieren mitzumachen? Wie werde ich ein guter Tutor? Das alles sind Fragen, die sich die meisten Studierenden stellen, wenn sie selbst ein Tutorium leiten. In dieser Tutorenschulung sollen solche Fragen aufgegriffen und geklärt werden. Weiterhin werden die folgenden Punkte angesprochen und praktisch erprobt:</description>
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