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        <description>Arbeitsgruppenseminar Genominformatik



392188 Stoye Winter 2011/12 Thursday 16-18 in U10-146 ekvv 
Course Description

In this seminar, current topics of the Genome Informatics research group are presented. 

(In dieser Veranstaltung wird in Vorträgen über aktuelle Themen aus der Forschung der Arbeitsgruppe Genominformatik berichtet.)</description>
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        <description>Algorithms in Genome Research



392109/10  Jens Stoye  Fr 10:15-11:45/Fr 8:45-10:15 in U10-146 ekvv/ekvv 
Contents:

This class covers the basic algorithmic techniques used in the computational analysis of genome and post-genome data. This includes algorithms for genomic mapping and assembly, methods for functional genome annotation (gene finding and gene function prediction), algorithms for the analysis of DNA microarrays and mass spectra, methods and models for protein structure prediction, a…</description>
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        <description>Bioinformatics Journal Club



392169 Stoye, Dörr Winter 2011/12 Thursday 18-20 in U10-146 ekvv 
Topics

We read and discuss current research articles from different fields in computational biology.  

Schedule
 Date  Topic  Name  Article  13.10.2011  Preliminaries</description>
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        <description>Phylogenetik

Dr. Roland Wittler
Vorlesung: Donnerstags, 8-10 Uhr in H8\\
Sprechstunde: Donnerstags, 14-15 Uhr und nach Absprache
Büro: U10-145 

Inhalt, Kommentar

Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein:</description>
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        <description>[ star.nex ]
[ xmastree.lhs ]


Phylogenetic tree with christmassy organisms

Sequences
OrganismURL to NCBIRangifer tarandus (reindeer)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/DQ318375.1?report=fastaCyprinus carpio (carp)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FJ710826.1?report=fastaBos taurus (ox)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_036642.1?report=fastaAbies alba (fir)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/DQ371809.1?report=fastaVisum album (Mistletoe)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/L24426.1?report=…</description>
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        <description>Grundlagen der Sequenzanalyse Wintersemester 2011/2012

Kurzbeschreibung

Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.</description>
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