https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/ 2026-05-13T01:11:48+0200 https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/ https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/ttps://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/lib/tpl/aggi-theme/images/favicon.ico text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/agseminar?rev=1581667636&do=diff Arbeitsgruppenseminar Genominformatik 392188 Stoye Winter 2012/13 Thursday 16-18 in U10-146 ekvv Course Description In this seminar, current topics of the Genome Informatics research group are presented. (In dieser Veranstaltung wird in Vorträgen über aktuelle Themen aus der Forschung der Arbeitsgruppe Genominformatik berichtet.) text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/alggr?rev=1581667636&do=diff Algorithms in Genome Research (Excerises) 392110 Linda Sundermann, Alexander Sczyrba Fr 8:30-12:00 in U10-146 ekvv Contents: This class covers the basic algorithmic techniques used in the computational analysis of genome and post-genome data. This includes algorithms for genomic mapping and assembly, methods for functional genome annotation (gene finding and gene function prediction), algorithms for the analysis of DNA microarrays and mass spectra, methods and models for protein structur… text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/journalclub?rev=1581667636&do=diff Bioinformatics Journal Club 392169 Thévenin, Stoye Winter 2012/13 Thursday 18-20 in U10-146 ekvv Topics * Encode project * RECOMB and WABI proceedings Schedule Date Topic Name Article 11.10.2012 Organizational Matters 18.10.2012 --- text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/phylogenetik?rev=1581667636&do=diff Phylogenetik Dr. Roland Wittler Vorlesung: Donnerstags, 8.30-10 Uhr in H11\\ Sprechstunde: Donnerstags, 14-15 Uhr und nach Absprache Büro: U10-145 Inhalt Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein: text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/phylogenetikintern?rev=1581667636&do=diff text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/sequenzanalyse?rev=1581667636&do=diff Sequenzanalyse, Wintersemester 2012/2013 392105/06 Stoye, Luhmann, Sundermann WS 2012/13 Di 9-10 in H15, Fr 8-10 in H3ekvv Kurzbeschreibung Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexit… text/html 2020-02-14T09:07:16+0200 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://gi.cebitec.uni-bielefeld.de/teaching/2012winter/variationchallenge?rev=1581667636&do=diff Variation calling challenge 392131 Mkinen WS 12/13 n.V. ekvv Content of the project You are given reference genome A and simulated short read data D from genome B. Genome B is variant of A with some simulated SNPs, and short and large indels. The task is to reconstruct B' from A and D such that B' is as close to B as possible. The closeness is measured by the alignment score of B’ and B; the alignment is produced by projecting the alignment of B’ to A, given by you, to the alignment of B’ t…