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--- teaching:2009winter:phylogenetik [2009/12/09 10:58]
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+====== Phylogenetik ======
+Dipl.-Inform. Roland Wittler\\ Dipl.-Inform. Peter Husemann\\ Prof. Dr. Jens Stoye\\
+===== Inhalt, Kommentar =====
+Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein:
+  * Diskussion der mathematischen und biologischen Grundbegriffe
+  * Formalisierungen des Baumrekonstruktionsproblems
+  * Merkmals- und distanzbasierte Rekonstruktionsalgorithmen
+  * Statistische Modellierung von Evolution und Maximum-Likelihood-Baumrekonstruktion
+  * Bewertung der Qualität von rekonstruierten Bäumen
+Das Vorlesungsskript ist nicht mehr verlinkt. Bitte beim Veranstalter fragen...
+===== Semesterapparat =====
+J. Felsenstein. Inferring Phylogenies. Sinauer, 2004.\\ R. D. M. Page, E. C. Holmes. Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell, 1998.\\ D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution. Sinauer, 2000.\\ D. M. Hillis, C. Moritz, B. K. Mable. Molecular Systematics. Sinauer, 1996.\\ M.A. Steel and C. Semple. Phylogenetics. Oxford University Press, 2003.\\
+===== Links =====
+[[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/CommonTree/wwwcmt.cgi|NCBI Taxonomy - Common Tree]]\\ [[http://itol.embl.de/|Interactive Tree of Life]]\\ [[http://www.phylowidget.org/full/|Online NEWICK Tree drawing tool]]\\
+\\ ([[:Teaching:2009winter:PhylogenetikIntern|Materialen (nur intern)]])
+===== Klausur =====
+Erfolgreiches Lösen der Übungsaufgaben (Bestehensgrenze 50%) und aktive Teilnahme an den Tutorien ("Vorrechnen") sind Voraussetzung für die Teilnahme an der  Abschlussklausur. Die Prüfungsaufgaben werden in der Regel wöchentlich ausgegeben. Die Klausur bezieht sich auf den Stoff der Vorlesung und der Übungen.
+**Die Klausur findet am 03.02.2009 von 8:30-10:00 in H9 statt.** Um frühzeitiges Erscheinen bis 8:15 wird gebeten.
+Die Modalitäten zur Nachprüfung werden später in der Vorlesung bekanntgegeben.
+===== Übungen =====
+Di, 10-12 vorerst in U10-155 (Peter)\\ Mi, 10-12 in U10-146 (Eyla)\\ Mi, 10-12 in M3-115 (Dominik)
+===== Übungsaufgaben =====
+| **Datum** | **Übungsblatt** |
+| 21.10.2009  | {{ 435uebung01.pdf | Blatt 1 }} |
+| 28.10.2009  | {{ 435uebung02.pdf | Blatt 2 }} |
+| 04.11.2009  | {{ 435uebung03.pdf | Blatt 3 }} |
+| 11.11.2009  | {{ 435uebung04.pdf | Blatt 4 }} |
+| 18.11.2009  | {{ 435uebung05.pdf | Blatt 5 }} |
+| 25.11.2009  | {{ 435uebung06.pdf | Blatt 6 }} |
+| 02.12.2009  | {{ 435uebung07.pdf | Blatt 7 }} |
+| 09.12.2009  | {{ 435uebung08.pdf | Blatt 8 }} |
+| 16.12.2009  | {{ 435uebung09.pdf | Blatt 9 }} |
+| 23.12.2009  | {{ 435uebung10.pdf | Blatt 10 }} |
+| 13.01.2010  | {{ 435uebung11.pdf | Blatt 11 }} |Back to [[:Teaching|Teaching]]

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