Sequenzen sind allgegenwärtig. Texte und Programme, Gene und Proteine, Polygonzüge, Sprach- und Bildsignale und digitalisiertes Vogelzwitschern werden dargestellt als Zeichenfolgen über einem endlichen Alphabet. Entsprechend vielfältig sind die algorithmischen Fragestellungen. Oft ist dabei der Datenumfang sehr groß, so dass die algorithmische Komplexität von entscheidender praktischer Bedeutung ist.
In der Vorlesung werden Algorithmen zum effizienten Vergleich von Sequenzen und zur Suche exakter und approximativer Muster in Sequenzen behandelt. Viele dieser Algorithmen sind durch bioinformatische Fragestellungen motiviert. Sie finden jedoch auch Anwendungen in anderen Bereichen wie z.B. der Textverarbeitung und der Datenkompression.
Wir bitten alle Studierende sich im ekvv fr Vorlesung und bungen zu registrieren. Dies erleichtert die Organisation der bungsgruppen. ekvv
Beginn ab 07.11.2011 !\\
Termin | Tutor | Raum |
Mo, 12-14 | Nina Luhmann | U10-146 |
Di, 12-14 | Jennifer Hess | U10-146 |
Di, 14-16 | Katharina Westerholt | M3-115 |
Mi, 10-12 | Linda Sundermann | U10-146 |
Mi, 12-14 | Nilofar Abdavi | U2-232 |
1. Klausur: Freitag, 10.02. um 13 Uhr, H6
Nachklausur: Donnerstag, 29.03. um 10 Uhr, H6
Datum | Übungszettel | Präsenzübungszettel |
04.11.2011 | Übungszettel 1 | Präsenzübungszettel 1 |
11.11.2011 | Übungszettel 2 HammingDistance.java | Präsenzübungszettel 2 |
18.11.2011 | Übungszettel 3 | Präsenzübungszettel 3 |
25.11.2011 | Übungszettel 4 EditDistance.java | kein Zettel |
02.12.2011 | Übungszettel 5 | kein Zettel |
9.12.2011 | Übungszettel 6 EditDistance_backtracing.java | Präsenzübungszettel 4 |
16.12.2011 | Übungszettel 7 NumberAlignments.java | Präsenzübungszettel 5 |
23.12.2011 | Übungszettel 8 | Präsenzübungszettel 6 |
13.01.2012 | Übungszettel 9 | kein Zettel |
20.01.2012 | Übungszettel 10 | Präsenzübungszettel 7 |