Phylogenetik

Dr. Roland Wittler
Vorlesung: Donnerstag, 10.15-11.45 Uhr in U10-146
Übungen: Freitag, 14:15-15:45 Uhr in U10-146
Sprechstunde: nach Vereinbarung
Büro: U10-145, U10-147

Inhalt

Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein:

Literaturempfehlungen

NCBI Taxonomy - Common Tree
Interactive Tree of Life
Online NEWICK Tree drawing tool
Splitstree (licensed but free)
Mobyle portal, a portal for bioinformatics analyses

Vorlesungsskript (Wird in der Vorlesung ausgegeben.)

Prüfungsleistung

Auszug aus dem Modulhandbuch: “Portfolio aus Übungsaufgaben, die veranstaltungsbegleitend […] und Abschlussklausur (90 min) oder mündlicher Abschlussprüfung (15-25 min). Die Übungsaufgaben ergänzen und vertiefen den Inhalt der Vorlesung. Mitarbeit in den Übungsgruppen (Zweimaliges Vorrechnen von Übungsaufgaben nach Aufforderung). […] Nachweis einer ausreichenden Zahl korrekt gelöster Übungsaufgaben (in der Regel 50% der im Semester für das Lösen der Aufgaben erzielbaren Punkte). Die Abschlussprüfung bezieht sich auf den Inhalt der Vorlesung und der Übung und dient der Bewertung.”

Prüfung

Mündliche Prüfungen im August. Termin wird noch bekannt gegeben. Termine für zweite Versuche nach Vereinbarung.

Übungen

Das Tutorium beginnt ab 12.04., freitags von 14:15-15:45 Uhr in U10-146

Übungsaufgaben

Datum Übungsblatt
04.04. Blatt 1
18.04. Blatt 2
25.04. Blatt 3
02.05. Blatt 4
09.05. Blatt 5
16.05. Blatt 6
23.05. Blatt 7
06.06. Blatt 8
13.06. Blatt 9
27.06. Blatt 10

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