Seminar: Spezielle Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume
Universität Bielefeld -
Technische Fakultät -
AG Genominformatik
Spezielle Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume
Seminar im Sommersemester 2003
Mittwoch, 12:00-13:30 Uhr, S0-115
Jens Stoye
Kurzbeschreibung
In diesem Seminar sollen klassische und moderne Algorithmen zur
Rekonstruktion phylogenetischer Bäume von den Teilnehmern des Seminars
selbstständig erarbeitet und präsentiert werden.
Alternativ zu einem Vortrag gibtes in dieser Veranstaltung die
Möglichkeit, zu speziellen Themenbereichen kurze Praktika
vorzubereiten, die dann mit allen Teilnehmern durchgeführt werden.
Voraussetzungen
Grundkenntnisse über phylogenetische Methoden, beispielsweise aus der
Veranstaltung Älgorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume",
sind hilfreich aber nicht zwingend erforderlich.
Themenvorschläge
(a) Vorträge
- Theorie der konvergenten Methoden (Warnow etc.)
- Die Methode der Invarianten
- Likelihood mapping und quartet mapping
- ...
(b) Praktikum
- Phylip - Vergleich verschiedener Methoden
- Splitstree - Vergleich von Split-Graphen und Bäumen
- Treeview und andere - Algorithmen zur Darstellung von Phylogenien
- ...