Algorithmen in der Genomforschung

Vorlesung im Wintersemester 2003

Donnerstag 8-10 Uhr in S2-143

Jens Stoye

Kurzbeschreibung

Die funktionelle Analyse von Genomdaten ist eine der großen Herausforderungen an die Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden die Grundlagen für bioinformatische Techniken in der Genomforschung behandelt. Hierunter fallen Algorithmen zur Genomkartierung und -assemblierung, Methoden zur funktionellen Genomannotation, insbesondere Genvorhersage und -funktionsbestimmung, Verfahren zur Analyse von DNA-Microarrays und Massenspektren, Methoden und Modelle zur Proteinstrukturvorhersage sowie Algorithmen zum Vergleich zweier oder mehrerer Genome. Vom Ablauf her wird sich die Vorlesung an den folgenden drei Fragen orientieren:

• Wo liegen die Gene im Genom?
• Was sind das für Gene?
• Wann und wie treten sie in Aktion?

Literatur:

D. W. Mount. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.