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teaching:2020summer:bioappgere [2020/02/14 09:07]
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 | **Date** ​   | **Topic** ​                                  | **Presentation** ​                                          | **Solution (for next day)** ​ | | **Date** ​   | **Topic** ​                                  | **Presentation** ​                                          | **Solution (for next day)** ​ |
-| Mon, 9.3.   ​| ​Shell                                       | Tizian: //Introduction to Python//                         ​|                          | +| Mon, 9.3.   ​| ​Metagenomics ​                        | Tizian: //Metagenomics//                            |                                                 ​| 
-| Tue, 10.3.   ​| ​Assembly ​                                   ​| TBA: //Genome Assembly, de Brujin Graphs//             ​|                       | +| Tue, 10.3.   ​| ​Hi-C Data Analysis ​                | TBA: //Hi-C//     ​|                       | 
-| Wed, 11.3.   ​| ​Finishing ​                                  | TBA: //BWA//                                           ​| ​                      | +| Wed, 11.3.   ​| ​Haplotype Inference I                                   | TBA: //WhatsHap//                                           ​| ​                      | 
-| Thu, 12.3.   ​| ​Genome rearrangements I                     | TBA: //Rearrangement distances//                          |                          | +| Thu, 12.3.   ​| ​Haplotype Inference II                     | TBA: //Integer Linear Programs//                           ​|                          | 
-| Fri, 13.3.   ​| ​Genome rearrangements II                    | TBA: //Circos tutorial//                                 ​| ​                        | +| Fri, 13.3.   ​| ​Assembly ​                   | TBA: //Genome Assembly, de Brujin Graphs//                                 ​| ​                        | 
-| Mon, 16.3.  | Gene Prediction ​                            | TBA: //Gene Prediction (software: Glimmer, Prodigal)//  |                        | +| Mon, 16.3.  | Finishing ​                            | TBA: //BWA//  |                        | 
-| Tue, 17.3.  | Hidden Markov Models (HMMs) ​                | TBA: //HMMs//                                           ​| ​                       | +| Tue, 17.3.  | Genome rearrangements ​                | TBA: //Rearrangement distances//                                           ​| ​                       | 
-| Wed, 18.3.  | Position-Specific Scoring Matrices ​(PSSMs)  | TBA: //PSSMs//                                           ​| ​                        | +| Wed, 18.3.  | Hidden Markov Models ​(HMMs)  | TBA: //HMMs//                                           ​| ​                        | 
-| Thu, 19.3.  | Metagenomics ​                               ​| TBA: //Metagenomics//                                     ​| ​                     |+| Thu, 19.3.  | Gene Prediction ​                              | TBA: //Gene Prediction (software: Glimmer, Prodigal)//                                     ​| ​                     |
 | Fri, 20.3.  | Finishing the Circos plot                   | --                                                         | --                           | | Fri, 20.3.  | Finishing the Circos plot                   | --                                                         | --                           |