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--- teaching:2020summer:phylogenetik [2020/04/15 17:05]
rwittler [Prüfung]
+++ teaching:2020summer:phylogenetik [2020/04/20 11:56]
rwittler
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 Dr. Roland Wittler\\
 Vorlesung: Montag, 10.15-11.45 Uhr\\
-Übungen: Freitag, 14.15-15.45 Uhr (wird ggf. in Absprache mit Teilnehmenden verlegt)\\
+Übungen: Freitag, 13.15-14.45 Uhr (eine Stunde vorverlegt)\\
 \\
 **Corona-Version:**\\
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 ===== Inhalt =====
-Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik. In dieser Vorlesung werden mit klar algorithmischem Schwerpunkt traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Themen werden u.a. sein:
+Die Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen ist eines der ältesten Arbeitsgebiete der Bioinformatik und umfasst ein großes Repertoire an algorithmischen Problemstellungen und Lösungstechniken. In dieser Vorlesung werden traditionelle und neuere Verfahren zur Rekonstruktion von phylogentischen Bäumen behandelt. Dabei liegt ein klarer Schwerpunkt auf der algorithmischen Problembehandlung, welche über die Phylogenetik hinaus Anwendung finden:
-  * Diskussion der mathematischen und biologischen Grundbegriffe
+   * Graphentheorie
-  * Formalisierungen des Baumrekonstruktionsproblems
+   * Dynamische Programmierung
-  * Merkmals- und distanzbasierte Rekonstruktionsalgorithmen
+   * Komplexitätsanaylse
-  * Statistische Modellierung von Evolution und Maximum-Likelihood-Baumrekonstruktion
+   * Clusteringverfahren
-  * Bewertung der Qualität von rekonstruierten Bäumen
+   * Maximum Likelihood
+Themen werden u.a. sein:
+   * Diskussion der mathematischen und biologischen Grundbegriffe
+   * Formalisierungen des Baumrekonstruktionsproblems
+   * Merkmals- und distanzbasierte Rekonstruktionsalgorithmen
+   * Statistische Modellierung von Evolution und Maximum-Likelihood-Baumrekonstruktion
+   * Bewertung der Qualität von rekonstruierten Bäumen
 ===== Vorlesungsskript =====
-{{ teaching:2019summer:phylogeny:phylogeny_ss19.pdf | Vorlesungsskript Vorjahr }}
+Siehe Lernraum.
-Neue Version noch in Arbeit.
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 ===== Übungen =====
-Das Tutorium beginnt ab ... (T.B.A.)
+Das Tutorium beginnt ab 24.04.
+Uhr c.t. via Zoom (Details siehe Lernraum)
-  * Bestehensgrenze 50% (siehe "Klausur")
+  * Übungszettel werden im Lernraum bereitgestellt
-  * Abgabe per Email.
+  * Abgabe über Lernraum bis Donnerstagabend
+  * Besprechung in derselben Woche freitags
   * keine Gruppenabgaben
+  * Bestehensgrenze 50% (siehe "Prüfung")
+\\
-===== Übungsaufgaben =====
+\\
+\\
-^ Datum ^ Übungsblatt ^
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung01.pdf | Blatt 1 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung02.pdf | Blatt 2 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung03.pdf | Blatt 3 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung04.pdf | Blatt 4 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung05.pdf | Blatt 5 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung06.pdf | Blatt 6 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung07.pdf | Blatt 7 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung08.pdf | Blatt 8 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung09.pdf | Blatt 9 }} |
-|  | {{ :teaching:2020summer:phylogeny:uebung10.pdf | Blatt 10 }} |
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