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--- teaching:2026summer:sa2 [2026/02/14 20:51]
jstoye [Übungen]
+++ teaching:2026summer:sa2 [2026/04/16 09:55] (current)
jstoye [Übungszettel]
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 ===== Literatur =====
-  * Das Skript zur Vorlesung: TBA
+  * Das Skript zur Vorlesung:  {{teaching:2026summer:sa2:sa2-2026.pdf | Sequence Analysis 2 - Lecture notes}}
   * Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press, New York, 1997.
   * Setubal, J. and Meidanis, J.: Introduction to Computational Biology. PWS Publishing, Boston, M.A., 1997.
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 | **Termin** | **Tutor*in** | **eKVV** |
-| Di 16-18 | NN | [[https://ekvv.uni-bielefeld.de/kvv_publ/publ/vd?id=655669395|Übungen A]] |
+| Di 16-18, U10-146 | NN | [[https://ekvv.uni-bielefeld.de/kvv_publ/publ/vd?id=655669395|Übungen A]] |
-| Do 14-16 | NN | [[https://ekvv.uni-bielefeld.de/kvv_publ/publ/vd?id=655671738|Übungen B]] |
+| Do 14-16, U10-146 | NN | [[https://ekvv.uni-bielefeld.de/kvv_publ/publ/vd?id=655671738|Übungen B]] |
 Für diejenigen, die die Abgaben mit Latex machen wollen, haben wir hier eine Vorlage: {{:teaching:2026summer:sa2:vorlage.zip|vorlage.zip}}
-Repository für praktische Übungen: https://gitlab.ub.uni-bielefeld.de/lbohnenkaemper/sqa-ex
+Repository für praktische Übungen: https://gitlab.ub.uni-bielefeld.de/lbohnenkaemper/sqa2ex
 ===== Prüfungstermine =====
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 ===== Übungszettel =====
-| **Datum** | **Abschnitt im Skript** | **Übungszettel** |
+| **Datum** | **Abschnitt im Skript** |
-| 13.04.2026 | 1. | |
+| 16.04.2026 | 1. Sequenzvergleich jenseits der Edit-Distanz |
-| 20.04.2026 | Praktischer Termin | -- |
+| 23.04.2026 | Praktischer Termin |
-| 27.04.2026 | 2. | |
+| 30.04.2026 | 2. Praktischer Einsatz von de-Bruijn-Graphen |
-| 07.05.2026 | Praktischer Termin | -- |
+| 07.05.2026 | Praktischer Termin |
-| 14.05.2026 | -- (Himmelfahrt) | -- |
+| 14.05.2026 | -- (Himmelfahrt) |
-| 21.05.2026 | 3. | |
+| 21.05.2026 | 3. Approximative Textsuche |
-| 28.05.2026 | Praktischer Termin | -- |
+| 28.05.2026 | Praktischer Termin |
-| 04.06.2026 | -- (Allerheiligen) | -- |
+| 04.06.2026 | -- (Allerheiligen) |
-| 11.06.2026 | 4. | |
+| 11.06.2026 | 4. Score-Matrizen |
-| 18.06.2026 | Praktischer Termin | -- |
+| 18.06.2026 | Praktischer Termin |
-| 25.06.2026 | 6. | |
+| 25.06.2026 | 5. RNA-Sekundärstrukturvorhersage |
-| 02.07.2026 | 7. | |
+| 02.07.2026 | 6. Paarweises Alignment mit linearem Platzbedarf |
-| 09.07.2026 | 8. | |
+| 09.07.2026 | 7. Suboptimale lokale Alignments |
-| 16.07.2026 | 9. | |
+| 16.07.2026 | 8. Exakte Algorithmen für Multiples Sequenzalignment |
-| 23.07.2026 | 10. | |
+| 23.07.2026 | 9./10. Approximation und Heuristiken für Multiples Sequenzalignment |

Genome Informatics

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