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teaching:2026summer:sa2 [2026/03/04 17:26]
jstoye [Übungszettel]
teaching:2026summer:sa2 [2026/04/16 09:55] (current)
jstoye [Übungszettel]
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 ===== Literatur ===== ===== Literatur =====
-  * Das Skript zur Vorlesung: ​TBA+  * Das Skript zur Vorlesung: ​ ​{{teaching:​2026summer:​sa2:​sa2-2026.pdf | Sequence Analysis 2 - Lecture notes}}
   * Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press, New York, 1997.    * Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press, New York, 1997. 
   * Setubal, J. and Meidanis, J.: Introduction to Computational Biology. PWS Publishing, Boston, M.A., 1997.  ​   * Setubal, J. and Meidanis, J.: Introduction to Computational Biology. PWS Publishing, Boston, M.A., 1997.  ​
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 | **Termin** | **Tutor*in** | **eKVV** | | **Termin** | **Tutor*in** | **eKVV** |
 | Di 16-18, U10-146 | NN | [[https://​ekvv.uni-bielefeld.de/​kvv_publ/​publ/​vd?​id=655669395|Übungen A]] | | Di 16-18, U10-146 | NN | [[https://​ekvv.uni-bielefeld.de/​kvv_publ/​publ/​vd?​id=655669395|Übungen A]] |
-| Do 14-16, U10-146 | NN | [[https://​ekvv.uni-bielefeld.de/​kvv_publ/​publ/​vd?​id=655671738|Übungen B]] |+| Do 14-16, U10-146 | NN | [[https://​ekvv.uni-bielefeld.de/​kvv_publ/​publ/​vd?​id=655671738|Übungen B]] | 
  
 Für diejenigen, die die Abgaben mit Latex machen wollen, haben wir hier eine Vorlage: {{:​teaching:​2026summer:​sa2:​vorlage.zip|vorlage.zip}} Für diejenigen, die die Abgaben mit Latex machen wollen, haben wir hier eine Vorlage: {{:​teaching:​2026summer:​sa2:​vorlage.zip|vorlage.zip}}
  
-Repository für praktische Übungen: https://​gitlab.ub.uni-bielefeld.de/​lbohnenkaemper/​sqa-ex+Repository für praktische Übungen: https://​gitlab.ub.uni-bielefeld.de/​lbohnenkaemper/​sqa2ex
  
 ===== Prüfungstermine ===== ===== Prüfungstermine =====
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 ===== Übungszettel ===== ===== Übungszettel =====
-| **Datum** | **Abschnitt im Skript** | **Übungszettel** | +| **Datum** | **Abschnitt im Skript** | 
-13.04.2026 | 1. Filteralgorithmen für die Edit-Distanz ​+16.04.2026 | 1. Sequenzvergleich jenseits der Edit-Distanz | 
-20.04.2026 | Praktischer Termin ​| -- +23.04.2026 | Praktischer Termin | 
-27.04.2026 | 2. Einsatz von de Bruijn Graphen ​+30.04.2026 | 2. Praktischer ​Einsatz von de-Bruijn-Graphen | 
-| 07.05.2026 | Praktischer Termin ​| -- +| 07.05.2026 | Praktischer Termin | 
-| 14.05.2026 | -- (Himmelfahrt) ​| -- +| 14.05.2026 | -- (Himmelfahrt) | 
-| 21.05.2026 | 3. Approximative Textsuche ​+| 21.05.2026 | 3. Approximative Textsuche | 
-| 28.05.2026 | Praktischer Termin ​| -- +| 28.05.2026 | Praktischer Termin | 
-| 04.06.2026 | -- (Allerheiligen) ​| -- +| 04.06.2026 | -- (Allerheiligen) | 
-| 11.06.2026 | 4. Score-Matrizen ​+| 11.06.2026 | 4. Score-Matrizen | 
-| 18.06.2026 | Praktischer Termin ​| -- +| 18.06.2026 | Praktischer Termin | 
-| 25.06.2026 | 5. RNA-Sekundärstrukturvorhersage ​+| 25.06.2026 | 5. RNA-Sekundärstrukturvorhersage | 
-| 02.07.2026 | 6. Paarweises Alignment mit linearem Platzbedarf ​+| 02.07.2026 | 6. Paarweises Alignment mit linearem Platzbedarf | 
-| 09.07.2026 | 7. Suboptimale lokale Alignments ​+| 09.07.2026 | 7. Suboptimale lokale Alignments | 
-| 16.07.2026 | 8. Exakte Algorithmen für Multiples Sequenzalignment ​+| 16.07.2026 | 8. Exakte Algorithmen für Multiples Sequenzalignment | 
-| 23.07.2026 | 9./10. Approximation und Heuristiken für Multiples Sequenzalignment ​|+| 23.07.2026 | 9./10. Approximation und Heuristiken für Multiples Sequenzalignment |